把论文变成可提问的科研知识库：Zotero + Obsidian + Codex 联动教程

最近在折腾一件事构建一个知识库。起因是这样我记得有篇论文讲多模板提示想找出来再看一遍但想不起标题。我的 Zotero 虽然按分类整理了可还是得挨个打开 PDF 翻挺耗时间的。所以我想换个做法把每篇论文的关键信息抽出来存成结构化的笔记再让 AI 连上这些笔记。以后想问什么直接搜自己的知识库就行不用靠记忆去猜。0. 工具准备这套流程主要用到三个工具。Zotero按照目录和标签管理论文 PDFObsidian保存精读笔记、模板、索引页和素材Codex读取 Zotero 中的论文按照 Obsidian 中编写的模板生成笔记再基于 Obsidian 中的笔记回答问题。1. 初步设置 Obsidian 仓库(1) 先在 Obsidian 里新建一个仓库比如叫Research Board。 然后建几个文件夹notes放精读后的论文笔记templates放精读模板indexs放论文索引页。(2) 在 templates 里新建一个精读模板paper-template.md后面 Codex 精读论文时就按会这个模板来写。精读模板可以根据自己的阅读习惯整理这里我举个例子想要这个例子的可以不用手敲在这里领取把论文变成可提问的科研知识库Zotero Obsidian Codex 联动教程2. 整理 Zotero 的论文Zotero 这边主要做两件事上传文献利用文件夹和标签管理文献。这里不建议把所有论文都堆在一个文件夹里。后面让 Codex 批量处理时文件夹越清楚指定范围就越方便。3. 设置 Codex(1) 打开 Codex进入 Obsidian 仓库所在的文件夹。忘记仓库位置也没关系Obsidian 左下可以查看路径。(2) 然后安装两个相关 SkillsZotero Analytical Workflow Skills: 用来从 Zotero 里读取论文并生成精读笔记。Research Board Literature Retrieval Skill: 用来检索 Obsidian 中已经整理好的论文笔记并基于这些笔记回答问题。这一步完成后Zotero、Obsidian 和 Codex 就连起来了。4. 精读论文(1) 批量精读 Zotero 整个目录中的论文可以告诉 Codex 目录名Codex 会自动按模板处理并整理到 Obsidian 对应目录中(2) 也可以精读某篇论文告诉 Codex 请处理 Zotero 中 “[目录名]” 目录下的论文 “[DPF名称]”。4. 安装 Obsidian 插件 DataviewDataview 可以读取每篇笔记开头的属性并且创建索引页形成你的科研知识库。(1) 在设置中的第三方插件中搜索 Dataview(2) 找到后安装点击启用。5. 基于知识库提问(1) 等 notes 里有了一批结构比较统一的笔记就可以让 Codex 基于这些内容回答问题。这里我举个例子当然也可以问的更具体一点。(2) 等某个方向积累到一定数量再让 Codex 基于 notes 做主题总结、方法比较或相关工作提纲。总结以前用 Zotero 只是存论文存完怎么用基本靠标签和脑子记。现在把 Zotero、Obsidian 和 Codex 串起来之后读过的每篇论文都能变成以后可以直接调用的素材阅读本身也成了一个持续积累的过程。本文用到的软件下载地址、模板文件、Skills 安装包和详细步骤我都打包好了。在这里领取把论文变成可提问的科研知识库Zotero Obsidian Codex 联动教程