手把手教你使用Brainstorm对数据进行溯源分析

Brainstorm是一款免费开源的脑电EEG、脑磁MEG和近红外fNIRS数据分析软件尤其擅长源定位分析。Brainstorm目前支持三类主流源定位方法Minimum Norm ImagingMNE、Beamformer和 Dipole Modeling偶极子拟合。其中MNE因稳定、快速、适用于ERP/ERF和组别分析是目前最常用的源定位方法之一也是本次教程的重点内容。本次教程基于https://neuroimage.usc.edu/brainstorm/Tutorials/HeadModelBrainstorm下载地址https://neuroimage.usc.edu/bst/download.php本次教程使用的matlab2020b可在茗创科技公众号后台回复‘matlab’获取本次教程使用数据资料可在公众号后台回复‘BSdata’获取添加好Brainstorm工具包后在命令行输入Brainstorm调出软件选择files-load protocol-load from folder选择资料中的Protocol01文件夹01对数据的头部模型前向模型进行建模右键点击S01_AEF_20131218_01_600Hz_notch文件选择Compute head model在弹出框保持默认选项点击OK运行完毕数据库中出现新文件右键该文件并选择Check spheres。将弹出用于计算头模型的球体通过该可视化确定传感器位置。对另一个数据进行同样操作不再赘述。02计算噪声协方差从载入的用于计算噪声协方差rawS01_Noise_20131218_02_600Hz_notch文件中计算噪声协方差右键选则Noise covarianceCompute from recordings在弹出的界面中保持默认选项及基线设置。可以通过Display as image查看噪声协方差矩阵。需要将计算出来的矩阵Copy to other folders复制到其他文件夹。03来源估计对ERP平均波形进行源定位并可视化对AVG:button数据右键选择Compute sources [2018]保持默认选项点击OK对计算好的带大脑图表的源文件右键选择Cortical activations Display on cortex展示脑源图删除先前计算的所有原文件,如AVG:button数据下的MN:MEG(Constr)04计算单试次源定位右键S01_AEF_20131218_01_600Hz_notch文件夹下的overlapping spheres选择Compute sources [2018]保持默认选项点击OK将生成一个白色大脑图标。对另一个数据进行同样操作。选中两个数据的AVG前缀数据拖动至下方files to processResults框内并将前侧选择process sources后点击run选项。在弹出界面中选择Average Average files并如图调整。在subject01文件夹下生成两个源平均文件可双击展示脑图。对数据进行低通滤波去噪将两个源平均文件拖动至处理窗口对数据进行低通滤波。对数据进行Z分数归一化将滤波后数据拖动至处理框选择Standardize Baseline normalization保持默认选项生成进行归一化后数据。